Обычный рентген (прицельный или панорамный) даёт плоское 2D-изображение с наложением анатомических структур. КЛКТ строит трёхмерную модель зубочелюстной системы, позволяя врачу изучать её в любом срезе и ракурсе. КТ видит то, что скрыто на рентгене: скрытый кариес, микротрещины корней, дополнительные каналы.